Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

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Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttbk1Q6PCN3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms