Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms