Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
AtmQ62388 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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AtmQ62388 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
AtmQ62388 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms