Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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