Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrn1Q61809 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrn1Q61809 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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