Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms