Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Trp53i11Q4QQM4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Trp53i11Q4QQM4 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trp53i11Q4QQM4 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trp53i11Q4QQM4 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trp53i11Q4QQM4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Trp53i11Q4QQM4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms