Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms