Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dlx5-201ENSMUST00000052609 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrp9b-202ENSMUST00000117909 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms