Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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