Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms