Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms