Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm6586-201ENSMUST00000167028 643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ttll1-202ENSMUST00000109479 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Mterf4-201ENSMUST00000027492 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm6555-201ENSMUST00000195167 789 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms