Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlkP97793 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlkP97793 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlkP97793 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlkP97793 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlkP97793 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AlkP97793 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlkP97793 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlkP97793 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlkP97793 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlkP97793 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AlkP97793 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AlkP97793 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AlkP97793 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AlkP97793 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms