Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gabpb2P81069 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms