Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtnP63089 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtnP63089 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtnP63089 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms