Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms