Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nphp4P59240 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms