Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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