Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TspoP50637 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TspoP50637 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms