Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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