Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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