Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ggta1P23336 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms