Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms