Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms