Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18533 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P18533 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms