Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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