Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC164612.2-201ENSMUST00000215737 719 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms