Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-Q1O19441 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms