Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Phactr1-202ENSMUST00000110161 1950 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Phc1-202ENSMUST00000081849 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Hacl1-214ENSMUST00000167175 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Wdr77-201ENSMUST00000010278 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Ccdc162-201ENSMUST00000019955 1891 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Nell1-202ENSMUST00000107603 2756 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Olfr411-203ENSMUST00000214769 2545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm26583-201ENSMUST00000181436 3684 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm44848-201ENSMUST00000207808 3234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Baiap3-204ENSMUST00000182435 3758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Cd200-202ENSMUST00000163230 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkcshO08795 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms