Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Vmn1r167G3UW71 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r167G3UW71 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Vmn1r167G3UW71 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vmn1r167G3UW71 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vmn1r167G3UW71 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vmn1r167G3UW71 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vmn1r167G3UW71 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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