Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3371F7CQW8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.5 ms