Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syngap1F6SEU4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms