Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms