Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms