Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms