Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs4Q9Z1T2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Thbs4Q9Z1T2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs4Q9Z1T2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms