Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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