Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms