Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Trim39Q9ESN2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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