Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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