Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms