Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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