Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Wdr55Q9CX97 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms