Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Chmp3Q9CQ10 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Chmp3Q9CQ10 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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