Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf19Q99KP6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms