Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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