Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms