Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trip10Q8CJ53 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms