Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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